Danke für eure Hilfe! Ich hab das Problem jetzt gefunden, es lag daran, dass die Instanzen admin.0 und discovery.0 ein Falscher Hostnamen zugeordnet war. Diesen wie folgt geändert:
iobroker list instances | grep -o -P "system\.adapter\.[^\.]+\.\d+" | awk '{system("iobroker object set " $1 " common.host=iobroker-hostname")}'Danach konnte ich die zwei Instanzen wieder deinstallieren und neu erstellen!
P.S.: Ausschlaggebend für die Lösung war übrigens dieser Post:
https://github.com/ioBroker/ioBroker.js-controller/issues/286
DANKE „buanet& AlCalzone “
buanet created this issue in ioBroker/ioBroker.js-controller closed iobroker host this not (fully) working #286